Ein Bug in den MySQL Server Versionen ab 5.5.20 (die von mir getestete Version 5.5.21 war ebenfalls betroffen) sorgt dafür, dass der Datenbank-Server nach einem Update eventuell nicht mehr gestartet werden kann.
Im Log findet sich dann folgende Fehlermeldung:
120223 20:03:12 InnoDB: Error: data file /var/lib/mysql/ibdata2 uses page size 1024,
120223 20:03:12 InnoDB: but the only supported page size in this release is=16384
Ein Bugfix von offizieller Seite existiert leider noch nicht. 5.5.19 ist die letzte Version, in der dieser Fehler noch nicht zu finden ist. Mittlerweile existiert auch ein Patch von Oracle.
Mehr zu diesem Problem gibt es im MySQL Bugtracker: #64160.